| 年份 | 專業名稱 | 論文作者 | 指導教師 | 論文題目 |
| 2003 | 化學工程 | 劉幽燕 | 胡英 | 脂肪酶催化拆分2-芳基丙酸的研究 |
| 化學工藝 | 周煒星 | 於遵宏 | 分形和應用多重分形理論及其在氣液兩相湍射流中的應用 | |
| 2005 | 化工過程機械 | 軒福貞 | 李培寧 | 工業壓力管道三通的塑性極限載荷工程分析 |
| 2009 | 生物化工 | 江正兵 | 魏東芝 | 不同來源脂肪酶基因克隆、表達及其酵母表面展示的研究 |
| 2010 | 生物化工 | 郁惠蕾 | 許建和 | 糖苷及糖苷酶的酶法合成研究 |
| 應用化學 | 馬 驤 | 田 禾 | 新型環糊精分子梭的合成及性能研究 | |
| 發酵工程 | 蘇二正 | 魏東芝 | 非水相中脂肪酶催化製備生物柴油的研究 | |
| 2011 | 化工過程機械 | 楊洪偉 | 欒偉玲 | CdSe量子點高溫合成微反應系統及工藝研究 |
| 應用化學 | 寧誌軍 | 田禾 | 新型星射狀染料敏化太陽能電池和電致發光材料的合成及性能研究 | |
| 2012 | 材料學 | 蔡春華 | 林嘉平 | 聚肽共聚物的合成🤲🏼、自組裝及載藥行為研究 |
| 化工過程機械 | 白誌山 | 塗善東 | 氣泡強化廢水旋流脫油機理及其工程應用的研究 | |
| 應用化學 | 郭誌前 | 朱為宏 | 基於吡喃腈和菁染料衍生物的分子邏輯門和熒光探針 | |
| 2013 | 先進材料與製備技術 | 莊小東 | 陳最 | 新型高分子信息存儲材料的設計與製備 |
| 製藥工程與技術 | 曾鐵強 | 宋恭華 | 基於氮雜卡賓或磁性納米顆粒的綠色催化體系設計及應用研究 | |
| 藥物化學 | 程探宇 | 徐玉芳 | 氟硼吡咯（BODIPY）類熒光探針的設計、合成與應用研究 |
註：全國優秀博士學位論文提名論文從2003年開始。
